Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprcP06800 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprcP06800 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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PtprcP06800 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprcP06800 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprcP06800 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprcP06800 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprcP06800 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprcP06800 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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