Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih2O35089 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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