Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GclmO09172 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GclmO09172 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GclmO09172 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms