Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Letm1Q9Z2I0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Letm1Q9Z2I0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms