Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms