Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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