Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrrdQ8K2M3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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