Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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