Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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