Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms