Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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