Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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