Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssxb10Q6XAR7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssxb10Q6XAR7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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