Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms