Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnna3Q65CL1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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