Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms