Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc18Q640L5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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