Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms