Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms