Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmem248Q3TBN1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmem248Q3TBN1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tmem248Q3TBN1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem248Q3TBN1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem248Q3TBN1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem248Q3TBN1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem248Q3TBN1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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