Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn2Q08093 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn2Q08093 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms