Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gfra1P97785 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms