Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtbP41155 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtbP41155 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms