Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa10P31310 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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