Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18526 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms