Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms