Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sclt1G5E861 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sclt1G5E861 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sclt1G5E861 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sclt1G5E861 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms