Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cfap46E9Q2C0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms