Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
2610021A01RikE9Q0Q3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2610021A01RikE9Q0Q3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms