Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brpf3B2KF05 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms