Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms