Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn6Q9Z262 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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