Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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