Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx12Q9ER00 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms