Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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