Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2cQ9D1C1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2cQ9D1C1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ube2cQ9D1C1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ube2cQ9D1C1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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