Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pink1Q99MQ3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pink1Q99MQ3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pink1Q99MQ3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pink1Q99MQ3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pink1Q99MQ3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pink1Q99MQ3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pink1Q99MQ3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms