Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nek5Q7TSC3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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