Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms