Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms