Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dnah12Q3V0Q1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dnah12Q3V0Q1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dnah12Q3V0Q1 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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