Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp11Q02853 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms