Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms