Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms