Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp4P59240 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp4P59240 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms