Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Setd4P58467 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms