Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms