Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VtnP29788 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms