Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms