Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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